Des symptômes invalidants

Des crises imprévisibles appelées " poussées " provoquent des douleurs abdominales, une grande fatigue et des diarrhées fréquentes (avec des saignements importants dans le cas de la recto-colite hémorragique), en alternance avec des périodes de rémission plus ou moins longues. Ces symptômes sont extrêmement gênants car ils peuvent aller : jusqu'à l'impossibilité de se retenir. Le handicap est réel, bien qu'invisible.
Dans certains cas, des  douleurs articulaires, des problèmes cutanés ou oculaires,
La perte d'appétit et l'amaigrissement sont très aigus dans la phase active de la maladie.
peuvent s'ajouter aux symptômes digestifs.